La variante Oh-My-God continue

Joseph Mazur

Anticorps fixant le SARS-CoV-2

Source : Joseph Mazur

Voici un titre d’actualité effrayant : « Un pic dans les cas de variantes Omicron met l’Europe à l’épreuve. » Quel bord ? Dans ce contexte, le mot signifie bord ou seuil, mais de quoi? Cela nous met en garde contre quelque chose de inquiétant et fait peur à ceux qui sont facilement inquiets à propos de COVID-19. Donc, dans cet article, je suggérerai courageusement que nous devrions enchaîner la peur venant des médias qui ne font pas attention aux mots.

Avec presque tous les articles de presse COVID que je lis, je suis stupéfait d’apprendre que les virus ont un avantage comme s’ils complotaient pour tuer, ou comme s’ils savaient comment muter pour échapper aux anticorps, ou comment construire efficacement des protéines de pointe suffisamment bien pour se lier aux récepteurs ACE2 pour entrer dans les cellules humaines. SARS-CoV-2 Ne sait rien. Il n’a pas de cerveau. Des mutations accidentelles pourraient le rendre très efficace pour se propager sans augmenter la morbidité.

Aris Katzourakis, chercheur en évolution virale à l’Université d’Oxford, est cité dans le journal La nature en disant : « Si vous le mettez dans le mélange dans une population hautement vaccinée qui a renoncé à d’autres mesures de contrôle, [SARS-CoV-2] pourrait avoir l’avantage là-bas. Qu’y a-t-il dans cette phrase qui devrait signaler une erreur de formulation ? Je suis sûr que Katzourakis ne voulait pas suggérer que le SRAS-CoV-2 a un plan pour gagner un avantage dans la bataille de la survie humaine. Il déforme ce que nous savons sur les mutations des virus. Les virus n’ont aucune volonté et certainement aucun plan d’attaque. Ils ne survivent que par des réplications aléatoires d’ARN. Comme pour toutes ces réplications chimiques, parfois, bien que rarement, des erreurs changent ce qu’il est. Il devient ce qu’il est par accident total. Les virus qui survivent le plus longtemps pourraient, par pur accident, avoir un « avantage », mais, encore une fois, seulement par accident.

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Que dire de cette nouvelle variante ? Malheureusement, pas grand-chose. Je ne suis ni virologue ni épidémiologiste mais plutôt mathématicien qui analyse le risque. Voici ce que je sais : au moins, Omicron n’est pas une variante aux conséquences élevées, que le CDC qualifie de “preuve claire que les mesures de prévention ou les contre-mesures médicales (MCM) ont une efficacité considérablement réduite par rapport aux variantes qui circulaient auparavant”.

En ce moment, Delta est la variante mondiale dominante de COVID-19 et le sera pour une période relativement courte. Lorsque le SRAS-CoV-2 frappe comme un virus Omicron (B.1.1.529), une variante préoccupante, il ne frappe pas comme un Delta (B.1.617.2) : ce ne peut pas être les deux, et il ne peut pas devenir les deux.

Identifié au Botswana et en Afrique du Sud après avoir infecté 10 000 personnes, il s’est propagé dans 50 pays sur six continents en moins de deux semaines. L’Organisation mondiale de la santé a désigné Omicron comme une variante préoccupante. Quelle est cette préoccupation? Surtout, que la montée rapide en Afrique du Sud a été explosive. Il y a deux semaines, 3 402 cas ont été signalés. La semaine dernière, il y a eu 8 561 cas, une augmentation de 152 % sur une période relativement courte. C’est le problème, car la variante Omicron provenait probablement de 26 nouvelles mutations qui n’ont jamais été observées dans aucune autre variante du SRAS-CoV-2. Mais ce n’est pas un sujet de grande conséquence, une inquiétude beaucoup, beaucoup, beaucoup plus élevée, selon le CDC.

Mais tenez bon. Voyons où se passe cette reprise alarmante. En septembre, le valeur R (les épidémiologistes mesurent la croissance d’une épidémie) de Delta – la variante dominante – était bien en dessous de 1. Maintenant que la valeur R pour la même région a presque doublé, ce qui pourrait signifier de sérieuses inquiétudes que cette nouvelle variante entraînera un doublement de la propagation dans le monde . Et nous savons ce que cela signifie à partir de l’exemple de l’échiquier mathématique : un grain de riz sur une case doublant à un adjacent en continuation épuise très rapidement tout le riz du monde bien avant d’atteindre la 64e case.

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Mais attendez, encore une fois. Ne sonnons pas l’alarme trop tôt. Nous ne connaissons pas le nombre de cas Omicron sur les 8 561 cas de la semaine dernière. Le calcul de la valeur R pour Omicron compte des cas mixtes. Un cas de Delta ne peut pas être un cas d’Omicron et vice versa. Il est peut-être vrai qu’Omicron se propage beaucoup plus rapidement que Delta, mais nous ne pouvons pas le savoir avec certitude tant que nous n’avons pas compté en utilisant les données de séquençage pour distinguer les variantes.

L’Omicron est très contagieux, mais peut-être pas si symptomatique : une étude suggère qu’il pourrait provoquer davantage d’infections mais pas nécessairement une maladie plus grave.

Toute cette préoccupation d’Omicron pourrait être dangereuse, non pas à cause de la puissance du virus, mais plutôt parce qu’elle joue avec la psyché pour favoriser par inadvertance la peur. Il se pourrait très bien qu’Omicron soit la réponse à nos problèmes. Comme je l’ai dit, le SARS-CoV-2 ne se décline pas en deux versions. Quand on attrape COVID-19, il s’agirait d’une variante, pas de deux. Alors, que se passe-t-il si Omicron a une valeur R inférieure à 1 et que nous assistons à un pic en Afrique du Sud simplement parce que l’Afrique du Sud n’est vaccinée qu’à 20 % ? Ou, pour le dire autrement, que se passe-t-il si la valeur R d’Omicron est supérieure à 1 mais a un niveau de morbidité inférieur ? Maintenant, nous avons une meilleure situation. Cela signifie que la puissance d’étalement d’Omicron surpassera celle de Delta. Et c’est un bon chose parce que cela réduira le taux de morbidité de COVID.

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Il pourrait arriver un moment où une variante (rappelez-vous : les mutations n’ont pas de plan d’attaque) confère accidentellement une immunité à la variante dominante (quel qu’elle soit) grâce à une accumulation d’anticorps et a également une valeur R supérieure à 1. Espérons alors. Dans ce cas, la variante dominante disparaîtra tant qu’elle n’aura pas le temps et les corps nécessaires pour effectuer suffisamment de mutations pour en créer une nouvelle, plus virulente. Espérons-le aussi.

Pfizer vient de publier une étude préliminaire en laboratoire démontrant que trois doses de son vaccin Pfizer-BioNTech COVID-19 neutralisent Omicron. Donc, jusqu’à ce que nous en sachions beaucoup plus sur Omicron, nous devrions adopter un bon comportement social, en suivant les directives du CDC, et ne pas être aussi effrayés par la nouvelle variante du bloc.

© 2021 Joseph Mazur